غالب طالبان پاکستان همانند طالبان افغانستان، پشتون هایی هستند که در مناطق شمال غربی پاکستان، در مرز با افغانستان، زندگی می کنند.
در واقع، 13جناح طالبان از مناطق مختلف شمال غربی پاکستان در بطن گروهی واحد به نام «طریق طالبان پاکستان» یا «جنبش طالبان پاکستان» گردهم آمده و تحت فرماندهی «بیت الله مسعود»- که در وزیرستان جنوبی، در مرز افغانستان، اقامت دارد- عمل می کنند. در ماه مارس، آمریکا برای دریافت هرگونه اطلاعاتی که به ردیابی و یا دستگیری این فرد منجر شود، 5میلیون دلار پاداش تعیین کرد.
وی از زمان حمله ارتش پاکستان به «مسجد سرخ» اسلام آباد در ژوئیه 2007، مسئول موجی از بمب گذاری های انتحاری در این کشور شناخته شده است. گفته می شود، قتل «بی نظیر بوتو»، نخست وزیر سابق پاکستان که در دسامبر 2007 در سوءقصدی در «راولپندی» جان باخت، را نیز او تدارک دیده است.
گروه طالبانی که ارتش پاکستان در «دره سوات» با آنان درگیر است، نیز به «طریق طالبان پاکستان» تعلق دارد. این گروه تحت فرمان «مولانا فضل الله» عمل می کند که پدر همسرش، «صوفی محمد»، در کنار طالبان افغانستان علیه نیروهای آمریکایی جنگیده بود. فرماندهان «طریق طالبان پاکستان» آموزش دیده های جنگ افغانستان هستند.
آنها از فقر، تفاوت های طبقاتی و احساس ضد آمریکایی مردم بهره برداری لازم را برای نیروگیری به عمل آورده اند.
به لحاظ تاریخی، جنبش طالبان افغان در اصل در پاکستان تولد و در سال های دهه 1990 در بین مردم آواره ای که در دهه های قبل در مقابل اشغالگران شوروی گریخته بودند، گسترش یافته است. پس از سقوط رژیم طالبان در کابل در پایان سال 2001، طلبه های دینی افغان از مرز گذشته و به مناطق پشتون نشین پاکستان پناه آوردند. «طریق طالبان پاکستان» با «ملا عمر»، سرکرده جنبش طالبان افغانستان بیعت کرده و اعتراف دارد که جنگجویان خود را برای جنگیدن در برابر نیروهای اشغالگر خارجی به خاک افغانستان روانه می سازد.
مع هذا، اختلافات استراتژیک جناح های مختلف گروه را در مقابل یکدیگر قرار داده است: گروه های تحت امر «مسعود» و «فضل الله» خواستار رویارویی مستقیم با نیروهای پاکستانی هستند، در حالی که سایر گروه ها مایلند تمرکز قوا، امکانات و منابع صرفا در صحنه افغانستان صورت پذیرد. از جمله گروه های طالب جنگیدن در افغانستان، «اتحاد شورای مجاهدین» است. منابع اطلاعاتی و کارشناسان مسائل امنیتی اطمینان می دهند که «بیت الله مسعود» از متحدان «القاعده» بوده و به بسیاری از جنگجویان خارجی وابسته به شبکه «اسامه بن لادن» و «ایمن الظواهری» پناه داده است.