فیلم بیشتر »»
کد خبر ۱۰۲۰۰۷۲
تاریخ انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳
کد ۱۰۲۰۰۷۲
انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

«پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنباله‌های پروتئینی در شبکه‌های مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.

به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

وی ادامه داد: بنابراین در کنار روش‏‌های آزمایشگاهی، از روش‌های محاسباتی نیز استفاده می‌‏شود. از روش‌های محاسباتی که برای پیش‌بینی بهترین کاندیدای داروها استفاده می‌‏شود، می‌‏توان به روش‌های سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روش‏‌ها می‌توان داروهای تأثیرگذار را پیش‌بینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.

این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین می‌شود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه‌ کشف دارو دارد.

وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا می‌‏توان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهره‌‏گیری از دانش اضافی موجود در مجموعه داده‌ها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها طراحی کرد؟

عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیش‌بینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.

برچسب ها: دارو ، یادگیری عمیق
ارسال به دوستان
captcha
پایان روند صعودی ۱۰ ساله دانشگاه‌های ایرانی در رتبه‌بندی تایمز لغو بازی دوستانه تیم ملی ایران با گینه بیسائو، به دلیل تحریم‌ها استقبال مردم ایتالیا از مستند «نازا» برای افشای نسل‌کشی رژیم صهیونیستی ترامپ، همه گیر می شود به بدترین شکلِ ممکن! / تحلیلی از توماس فریدمن حاشیه و متن یک اسکار با طعم ایران پسر رئیس پتروشیمی، خواننده شد درخواست ترامپ از فرانسه و آلمان برای آزاد کردن ذخائر گازوئیل ادعای رویترز: دیدار محرمانه حزب الله لبنان و دولت جدید سوریه در ترکیه قیمت دلار، طلا و سکه امروز پنجشنبه ۹ مهر ۱۴۰۵ ضیافت شام پادشاه اسپانیا برای مکرون (+عکس) / هدیه پادشاه چه بود؟ نمایندگی ایران: هیات ایرانی طبق برنامه نیویورک را ترک کرد تحلیل یک روزنامه از پشت‌پرده حادثه فلای‌دبی: توطئه علیه ایران است فرانسه بدهکار «بیمار جدید اروپا» لقب گرفت معمای برند اتاق بازرگانی ایران؛‌ صدای بخش خصوصی، شریک دولت یا باشگاه بزرگان؟ کالابرگ در آستانه افزایش/ملک و خودرو شرط جدید دولت شد