۰۴ دی ۱۴۰۴
به روز شده در: ۰۴ دی ۱۴۰۴ - ۰۶:۰۰
فیلم بیشتر »»
کد خبر ۱۰۲۰۰۷۲
تاریخ انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳
کد ۱۰۲۰۰۷۲
انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

«پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنباله‌های پروتئینی در شبکه‌های مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.

به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

وی ادامه داد: بنابراین در کنار روش‏‌های آزمایشگاهی، از روش‌های محاسباتی نیز استفاده می‌‏شود. از روش‌های محاسباتی که برای پیش‌بینی بهترین کاندیدای داروها استفاده می‌‏شود، می‌‏توان به روش‌های سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روش‏‌ها می‌توان داروهای تأثیرگذار را پیش‌بینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.

این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین می‌شود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه‌ کشف دارو دارد.

وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا می‌‏توان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهره‌‏گیری از دانش اضافی موجود در مجموعه داده‌ها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها طراحی کرد؟

عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیش‌بینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.

برچسب ها: دارو ، یادگیری عمیق
ارسال به دوستان
۵۰ سال پیش؛ عکس‌های دیدنی اردوگاه گدایان تهران را ببینید! تأیید استفاده از رنگ طبیعی قرمز حاصل از پوست برخی حشرات در محصولات غذایی «عارف لرستانی» در 27 سالگی و در اولین برنامه تلویزیونی اش؛ سال 77(عکس) خوابیدن ساعت‌های اتمی؛ زمان رسمی آمریکا هفته گذشته چند میکروثانیه عقب ماند در زمستان خطر کم آبی بدن بیشتر از آن چیزی است که فکر می‌کنید ۱۰ زبان‌ پرگویش‌ جهان؛ انگلیسی و چینی در صدر(+اینفوگرافیک) ۵ غذای برتر حاوی ویتامین D  داود رشیدی در حال شوخی کردن با مسعود بهنود؛ سال ۵۰ (عکس) تاثیر مصرف کره بر فشار خون؛ پزشکان چه می‌گویند؟ ساغر عزیزی: به خاطر عذاب وجدان، دستم را روی اجاق گاز می سوزاندم بزرگ‌ترین سازنده پهپاد جهان از آمریکا اخراج شد امیر حسین رستمی: در کانادا فکر کردند من بمب گذارم ساغر عزیزی: به جرم داشتن لوازم آرایش، شوهرم جورابش را در دهانم کرد و از من اعتراف گرفت ادعای نتانیاهو: تهدید‌های جدیدی از سوی تهران در حال ظهور هستند/ به دنبال درگیری نیستیم، اما چشمان‌مان باز است تمرکز نیروهای نظامی آمریکا بر «قرنطینه» ونزوئلا